官兵发动兵变，成立了南方人民军，不愿意放弃自己的宗教信仰，不甘心接受喀士穆政府的统治的南方各部族纷纷响应，南方人民军疾风劲草般壮大起来，第二次苏丹内战就此爆发。
像苏丹这样一个幅员辽阔、资源丰富的国家，不知道有多少国家在暗中盯着，垂涎三尺，现在兄弟阅于阋墙，那些豺狗自然不甘寂寞，纷纷跳出来上蹿下跳，准备从他们身上狠狠地挖上一勺利益。以伊朗、沙特、埃及、利比亚为首的一票中东国家出于宗教情感，明里暗里给予喀士穆政府大量的援助，像利比亚，干脆就直接出兵去帮喀士穆政府打仗。可惜利比亚军队的战斗力太菜了，不仅没能获得胜利，还屡屡被南方人民军打崩，颜面扫地。而乍得、埃塞俄比亚等等国家则将这场战争视为阿拉伯裔对黑大陆的入侵，认为他们想重演七世纪那场席卷欧亚非三大洲的大征服……源于对一手持剑一手持经的阿拉伯武士那深入骨髓的恐惧，这些国家同样是有钱的捧钱场，没钱的捧人场，努力资助南方人民军，让他们去跟喀士穆政府死磕。在他们眼里，南苏丹就是抵御阿拉伯人入侵的前哨，万万不容有失！
宗教战争是世界上最残酷的战争，这种战争压根就不存在什么投降输一半，甚至不存在任何形式的妥协，除非有一方彻底认输，否则是绝对不会停下来的。而宗教战争中又混合着大量种族冲突，苏丹是个多民族国家，托了英国佬的福，这些民族彼此看对方不顺眼，相互仇杀，结下了血海深仇，内战爆发，这些民族有冤报冤，有仇报仇，你来我往杀得两眼发红。而种族战争同样是非常残酷的，这个可以参考卢旺达内战和波黑内战，双方是真的想将另一方斩尽杀绝，他们认为只有对方死绝了，这场战争才能结束。
如果仅仅是宗教、种族也就算了，更倒霉的是，就在内战打得如火如荼的时候，苏丹南部的达尔富尔州发现了海量的石油。这下可完蛋了，各国资本纷纷进场，争夺这块大蛋糕，而南北双方也不约而同地将达尔富尔地区当成了战争的胜负手……石油就意味着取之不尽的财富，而财富就意味着军火、补给，这道理谁都懂。在他们身后，各国资本纷纷发力，扶持自己的势力，他们出钱，苏丹人出命，为了石油杀得血流成河！
宗教、种族、石油，三大最不可调和的因素苏丹全部集齐，这个国家的命运就可想而知了。
巴希尔总统是在八十年代末上台的。当时苏联政府军在南方战场连吃败仗，不断丢城失地，损兵折将，眼看就要崩了。这位铁腕强人上台之后先是释放