方以智没有闲着，他第一件事就是把这事写了封信给杨子正，前自道歉，并表明自己会辞官去安南助杨子正的生意，他当然知道杨子正做的是什么生意了。
他过去除了自责之外，也是想要劝一劝杨子正别跟大明起了冲突。
说实在的，这大明末年倒还是有不少的读书人向着大明的，哪怕大明最后亡了，他们死都不愿意再出仕。
这方以智就是其中一位，崇祯死后，他在崇祯灵前痛哭，被李自成部下严打都宁死不屈，后因清军入关北京大乱，他才侥幸南逃。
永历四年，清兵攻陷广西平乐，方以智被捕，清军在方以智的左边放了一件清军的官服，右边放了一把明晃晃的刀，让方以智选择。方以智毫不犹豫，立即奔到右边，表示宁死不降。满清将领相当欣赏他的气节，于是将他释放。
顺治七年，披缁为僧，改名弘智，字无可，别号大智、药地、愚者大师等。晚年定居江西庐陵青原山净居寺，自称极丸老人。
康熙十年冬，方以智为粤事牵连被捕，解往广东，途经江西万安惶恐滩头，十月七日因疽发卒于舟中。
看看他这一生，说得上是对崇祯是忠心耿耿的，对大明是奉献了一生的。
他极力的想拉杨子正入大明阵营，就是不想看到杨子正与大明为敌。
而他果断想着要辞官南下便是希望能劝住杨子正别北上攻伐大明。
其实这也是杨子正不大喜欢用大明官员的原因，除非是像茅元仪这种……说白了，茅元仪也跟他说过，他是不会与大明为敌的。
大明的很多官员确实是很有气节的，不得不佩服儒家有时候它也有它的优点的，这也是杨子正一直没有全盘否定儒的原因。
方以智写完信后，看了两遍便装进信封，然后叫来管事。
“把这封送到中华邮行，让他们同他们的急信一起转交给杨子正吧。另外，跟中华邮行说一声，不管上头追不追究科学，我都准备辞官去安南，让中华邮行帮我安排一下。”
方以智决定了，因为他明白他现在在庙堂之上就是被冠以科学代言人的头衔，如今皇帝否定了科学，那他这科学代言人为官将更加的艰难，既然如此，还不如去安南帮大明挡一挡崛起的杨子正。
历史会证明他方以智对大明的忠心的。
等管事的人走了后，方以智便开始收拾他的书与笔墨，其它的都不重要这些才重要，他平时也是一个爱写书之人。
要不然《物理小识》这种书怎么会写出来，他学习了科学之道后更加的喜欢写点心得了。
……
曾永写完信后正准备让人急件送往安南，这时方以智的信与传话也来，曾永也是苦笑了下，点了点头便收下信，与让人安排方以智南下事宜。
在薛府
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