杨子正设置的中华人民军设定的建制不是像大明军队一样的小旗、总旗、百户、千户、卫、都司、都督府，最后是五军都督府。
中华人民军设置的跟后世的军队一样，是以班、排、连，营、团、旅、师、军，最后是大都督府。
每个军下面三个师，每个师下面三个旅，每个旅下面三个团……一直是三三制延续到班。
一团之军力以上级别战力设置了参谋部，所有军事行动必须要经过参谋部商议后才能让团级军官行使军令，当然，团长可以不听参谋部的建议，但是必须要走这么一个流程。
这是为了让参谋部分析怎么战斗更有利，把各种方式的战斗利弊分析给团长，团长选择哪种那是团长的权力。
这相当于明军的将军帐下幕僚，不过杨子正让这些幕僚归属在正式编制当中，严格来说他们是指挥将军的下属，但实际是指挥将军的同事，而不是像现在的明军当中幕僚明着同事，实际上是将军的私人谋士。
这个设置说新奇也不新奇，其实所有军中都有设置，只是……归属不同了。
除了这个还有一个更有意思的是，中华人民军设置了一个千户，不，中华人民军叫一个团，每个团里都设置了军法官，军政官，军需官，此三官平时连团长、营长、连长都无权力管辖，当然如果是战时，必须要听从主官的战斗任务分配。
这三官是干嘛的呢？军法官是执行军法的，无论是谁犯了军法都由军法官来执行，军政官是来记录军功以及帮助士兵做思想政治工作的。
茅元仪不清楚这思想政治工作是指什么，但是这杨子正的册子上写着是这样，不过这一职位有点像明军里的内廷监军的意思，但是工作更具体与实质。
军需官呢？是为了随时了解军队内军需要求与状况的，好及时解决，同时也是发放军响的。
这个设置是为了不让主军官接触与贪污军饷与军需军备。
茅元仪被杨子正的这一套设计给征服了，他是带过兵的，当然知道军队里的问题有哪些，有些糜烂的军队底层士兵食不果腹，拿不到军响，甚至没有一把像样的兵器。
这些粮饷与兵器军需都去哪了？全被主官给贪了啊，现在杨子正把军队的权力给打散了，主官没了发军响的权力，没了筹军备的权力，甚至执行军法都不归主官去管，那主官能干嘛？只能去打仗立功，为了让主官打好仗，杨子正把主官的幕僚团给正规化了，叫参谋部，连主官的亲兵也给剥夺了，搞了个警卫团，警卫营，警卫连。
虽然茅元仪认为这完全把将军的权力给削掉了，放到明军里边将军会撂挑子不干的。但同时他也不得不承认这样的做法确实在高明，有效的防止了军队的哗变、腐败以
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