盐制改革已经告一段落，又不准备在扬州府清理官场设置镇村，朱由检在扬州的事情其实已经告一段落。按道理来说应该继续南下前往南京祭祖，可他却在扬州城逗留了多日。
之所以在扬州停留自然不是沉溺于扬州的繁华，也不是因为扬州瘦马的美色，而是对各地的形势有些忧心。
北京城朝堂的发生的事情朱由检并不在意，有镇守北京城的上万禁卫军在，朝廷那帮文官便翻不了天。河南农民造反愈演愈烈，朱由检也不是十分担心，因为三万禁卫军即将南下抵达黄河。三万久经沙场的禁卫边兵，岂是农民军这样的乌合之众所能抗衡？只要三万禁卫军一到河南，平定民乱便用不了多长时间。
真正让朱由检忧心的是江西的局势。
根据情报，江西造反的贼军已经达到二十万之多，正在围攻南昌城。不久前朝廷已经下令调遣湖广、浙江、南直数省军队增援江西围剿贼军。然而想想江西造反的贼军数年来的情形，朱由检对各省军队能否击败贼军很是怀疑。
四年前，赣南山区出现多处百姓造反，朱由检下旨起复袁崇焕为江西巡抚，负责***西反贼。当时很多朝臣推举袁崇焕继任蓟辽督师，朱由检却对袁崇焕并不感冒。但想着袁崇焕终归能力不差，便把他派往了江西。
几年来，袁崇焕在江西剿贼可谓兢兢业业，先后剿灭数处反贼，把最后的几股贼军堵在了赣南深山之中。按照当时形势，很快便能把江西反贼彻底平定。
然而谁知道就在去年秋，被赶入深山的贼军突然杀出，竟然诡异的击败了袁崇焕亲领的军队。据说这些贼军装有大量制作精良的火铳，论装备竟然碾压了袁崇焕手中的官军。
袁崇焕兵败赣州，一路退向了吉安府，反贼尾随追击，杀进了吉安府。袁崇焕原想据守吉安府城庐陵等待援军。谁知道庐陵城中竟然有贼军内应，帮贼军打开了城门，袁崇焕无奈之下，只能一路败退，经临江府一直退到了南昌城。官军败退，贼军一路尾随攻城略地，很快占据了江西南部各府。赣州、南安、吉安、抚州、临江，江西南部数府皆为贼军占据。
而且根据密探汇报，江西贼军纪律严密，并不抄掠士绅百姓，深得士绅百姓爱戴。无数百姓纷纷投军，大半年时间，人数发展到了数十万之众。
江西反贼击败袁崇焕的消息传到北京时，朱由检并没有在意。因为他清楚虽然江西屡屡有百姓造反，但上一世并未形成规模，从来都是被官军轻易镇压。况且有百姓造反也是好事，最好借着造反百姓的手杀戮一番地方士绅，也好为将来的改革去除阻力。
所以当时朱由检只是随意下旨，让地方官府自行围剿反贼，并未有动用禁卫