吏们同劳工们一起，把一箱箱的货物装上了船，然后坐船北上，迁往燕京。
小官和小吏们先行出发，之后是朝廷的中高级官员们，朝廷衙门的办公用品不需要他们来搬运，前面走的小官小吏们已经搬走了，而这些中高级官员家中奴仆丫鬟众多，奴仆们把一箱箱的行李装上了船，官员们和家人坐上船，往北航行，踏上了北迁之路。
赵鹏的宋国公府仍然留在南方，但是朱慈烺给他在北方安排了一座公主府，赵鹏在南方的时候住在宋国公府内，而去了北方后，就住在坤兴公主的公主府内。
大明朝廷开始迁都了，赵鹏不需要动，因为北方的公主府会是新造的一座府邸，等绍武帝朱慈烺去了北方后，皇帝陛下会安排韩赞周建造公主府，并把里面的家具都布置妥当，这些事根本不需要赵鹏操心，他就留在南京，专心打造海军就是了。
这段时间内，赵鹏就在南京造船厂打造舰船，同时训练新的海军陆战队。当一批新的海军陆战队训练出来以后，他亲自带上这批两千人的海军陆战队前往琉球王国，同琉球国主尚质正式签订了大明琉球条约的同时，也把一批已经在琉球王国驻守了近半年的海军陆战队员给替换回来了。
询问了琉球国主尚质后得知，这半年来，萨摩藩又派了一次人偷偷在琉球登陆。结果萨摩藩的兵登陆到一半，被明军发现，大明海军击溃了萨摩藩船队。陆上的大明海军陆战队歼灭了已经登陆琉球的萨摩藩陆军，取得了一场大捷，从此萨摩藩就再也不敢来了。